【連載-企業參考品】 神經膠質瘤的診斷參考品的選擇

科佰生物作為一家提供企業核酸診斷標準品的企業，在該領域已經深耕多年，與全國該領域90%的企業都有過合作，成功支持過很多企業的試劑盒研發和獲批，在該領域有豐富的經驗。根據我們對市場的調研，對客戶需求的理解，我們把我們的產品線劃分為多個模塊，主要為支持PCR的單點Mutation、Fusion和CNV產品，支持NGS的小panel和大panel(泛腫瘤、包含TMB和MSI)產品，支持IHC和FISH的FFPE block產品，支持標準品定標的dPCR檢測試劑盒產品等。

接下來的幾期，我們陸續會針對不同的腫瘤，遵循NCCN指南的標注，為大家分享我們對企業參考品選擇的看法。

中樞神經系統腫瘤中85％生長于顱內；15％生長于椎管內。顱內腫瘤以膠質瘤多(占42％)，椎管內腫瘤以神經鞘膜瘤多(占48％)；腦膜瘤次之(占15～18％)，垂體腺瘤、先天性腫瘤、血管性腫瘤及其他腫瘤均在10％以下。

神經膠質瘤簡稱膠質瘤，也稱為膠質細胞瘤，是常見的原發性中樞神經系統腫瘤，約占所有顱內原發腫瘤的一半，廣義是指所有神經上皮來源的腫瘤，狹義是指源于各類膠質細胞的腫瘤。

根據CBTRUS統計，惡性膠質瘤約占原發性惡性腦腫瘤的70%，年發生率約為5/100000，每年新發病例超過14000例，65歲以上人群中發病率明顯增高。

膠質瘤的死亡率高，據文獻報道，中國膠質瘤年發病率為3-6人/10萬人，年死亡人數達3萬人。

雖然發病率和死亡率，相較于其他腫瘤并不高，但是據柳葉刀子刊《神經病學》（Neurology）研究文章顯示，大規模腦腫瘤統計發現，在范圍內，中國的發病及死亡人數雙雙較高。

 在2019年V3版的NCCN指南描述，針對Gliomas主要有以下幾類生物標志物，依次為：IDH1和IDH2突變、1p19q LOH、MGMT基因的甲基化、ATRX的功能缺失突變、TERT突變、H3F3A突變、BRAF突變和融合、RELA 融合突變、EGFR 跳讀和EGFR的擴增。

 IDH1和IDH2基因

IDH1和IDH2的突變，會造成D-2-hydroxyglutarate的表達異常，常見的IDH1突變是R132H，推薦IHC檢測，如果是陰性的話，建議對IDH1和IDH2全部測序(sanger or NGS)。

科佰生物提供一系列IDH1和IDH2 mutaion的標準品，產品陸續增加中：

 1p19q LOH

臨床發現不平衡的易位(1；19)(q10；p10)導致整個1p和19q臂的缺失，與IDH的突變密切相關，1p19q LOH和IDH的突變，對臨床給藥都有明確的幫助。

1p19q LOH標準品，正在研發中。

 MGMT promoter的甲基化

MGMT是一個DNA修復酶，對抗一些化療藥物，啟動子區域的甲基化可以沉默MGMT基因，導致對化療藥物的敏感。

科佰生物提供的標準品，含有甲基化的詳細位點、甲基化程度。

 ATRX 基因突變

ATRX是染色體調整蛋白，突變導致的功能缺失會導致ALT（端粒延長替代），臨床可用IHC和測序來檢測。

科佰提供一系列ATRX的Pathogenic的標準品。

 TERT啟動子區域突變

TERT是編碼端粒酶的催化激活位點，維持細胞分析時端粒的正常長度，TERT的突變發生在非編碼區的啟動子區域，突變提高了TERT的表達，對臨床給藥和預后都有很大的指導意義。

 H3F3A Mutation

常見的Histone突變是K27M，抑制了H3.3的*基化，其次是G34的突變，在兒童大腦皮層神經膠質瘤也常見。因此臨床往往是選擇測序，同時能檢測K27M和G34。

H3K27M和H3G34標準品，正在研發中。

 BRAF突變

BRAF突變，尤其是V600E在很多腫瘤中，都能看到，在膠質瘤中，也同樣重要。另外BRAF的fusion也建議被檢測，可以檢測常見的KIAA1549基因。

 BRAF-KIAA1549 Fusion標準品，正在研發中。

 RELA Fusion

在兒童上皮神經膠質瘤常見RELA的融合突變，RELA的融合導致NFkB信號通路活化，常見的融合伴侶是C11orf95。

C11orf95-RELA Fusion標準品，正在研發中。

EGFR 跳讀和EGFR的擴增

 雖然在NCCN指南中沒有提及EGFR VIII和EGFR CNV的分子標記，在臨床中的作用，但是EGFRvIII是GBM中常見的EGFR突變，在約60-70％EGFR擴增的原發性GBM腫瘤中發現，并且是實驗療法的潛在靶標。

綜上，按照NCCN的指南，按照臨床的藥物，按照伴隨診斷的需求，科佰生物開發了針對神經膠質瘤（Glioma）的各種參考品、標準品，適合不同的應用，滿足不同客戶的需求。

標準品選擇好了，接下來就是做性能評價，讓我們先學習下指導原則，對于性能評價的規定。

詳見《從《指導原則》中分析參考品盤設計》。